（三）监督机制不健全
　　企业内部控制最重要的组成部分就是监督机制，然而我国多数企业只注重监督制度的制定，不重视制度的执行。从而监督也成了企业内部控制的一个薄弱点。企业信息化也给监督机制带来了挑战，第一，企业信息化改变了传统的职能型组织结构，由于矩阵型组织结构不利于权责划分，监督工作开展起来困难重重。第二，部分企业将内部审计外包，内部审计外包不能从企业信息化的高度来核查监督企业内部控制的有效程度。第三，企业信息化环境下业务流程发生改变，相关人员缺乏信息化环境的内部控制监督经验，导致内部控制监督困难。第四，会计信息化环境下的授权控制在管理信息系统中自动完成，授权过程不明显导致难以及时监督。
　　三、会计信息系统内部控制的实施
　　（一）会计信息系统内部控制实施的目标
　　根据系统理论的相关知识，系统目标决定了系统的功能、程序、实现方法和运行机制，即系统的构成要素要以系统目标为中心。同理，企业实施会计信息系统内部控制也要以确定内部控制目标为首要任务。企业的根本目标是获得盈利以实现生存发展，但同时还要应对各种风险，保证企业获得可持续发展。因此，会计信息系统内部控制实施的目标以企业根本目标为宗旨，就是在实现全面风险管理的基础上实现企业价值的最大化。
　　（二）会计信息系统内部控制实施的原则
　　会计信息系统内部控制实施的原则首先是合法性原则，保证内部控制符合国家法律、法规和相关监管部门规章的要求。会计信息系统内部控制实施应遵循全面性和系统性原则，无论是在层次上还是流程上都应涵盖各方面、各个环节，另外内部控制也要涵盖各项业务，保证各项业务在系统连贯完成，不能相互矛盾，以此避免内部控制漏洞和空白的存在。制衡性原则也是会计信息系统内部控制实施应遵循的原则，内部控制的实施应确保不同岗位、部门之间权责分明，从而有利于各岗位、各部门相互监督和相互制约，其中最重要的是内部控制监督检查部门具有独立性。会计信息系统内部控制实施要与企业治理结构相适应，一个健全的公司治理结构是内部控制成功实施的重要内部条件，两者相互促进，内部控制只有在健全的公司治理结构中才能发挥良好作用，内部控制的深化也促进治理结构的完善。
　　（三）会计信息系统内部控制实施的关键点
　　内部控制实施的关键点指的是对整个内部控制体系起到关键影响的重点环节，它决定着企业各项业务活动内部控制目标的实现。考虑到企业的成本收益，会计信息系统内部控制的实施要有所重点，而这些关键点即实施工作的重要着力点。
　　1.组织与规划方面的控制
　　组织与规划方面的控制主要包括设置组织机构、权责划分、上机操作管理、会计档案管理以及设备管理。会计信息系统要求适当调整原有组织机构，注意相关人员配备以及训练管理，特别要注意组织结构扁平化。组织内部重视纵向的权力和责任相匹配、横向同级各部门的协调性问题。健全授权审批检查制度和人事政策，真正实现因事设岗，重视对员工的激励约束作用。另外，设置组织机构还要与企业规模和经营目标相适合。根据会计信息处理过程将会计岗位分为三组，分别是数据收集输入组、数据处理组和会计信息分析组。不相容职务一定要相互分离，建立职务轮换制度也是必要的。上机操作管理措施一般包括上机操作手册、上机记录制度、上机时间安排和轮流值班制度等，并明确上机操作内容和权限，专人保管操作日记。档案管理人员应根据档案制度对会计信息系统的档案及时存档，并定期备份。建立计算机硬件设备管理制度，各自使用自己职责范围内的设备，并严格登记，定期对设备进行检查检修。
　　2.实施方面的控制
　　实施方面的控制主要有资金预算、符合标准规范、人员培训和程序修改控制。会计信息系统内部控制实施耗费的资金较大，为保证实施过程中人力、物力、财力充足，应严格管理专项资金的使用。会计信息系统的建设应符合国家标准和规范，这样才能保证和其他系统有机结合，实现数据共享和交换，也有利于未来系统的更新升级。在会计信息系统建设过程中就应对相关人员进行培训，以此减少未来的操作失误。新会计信息系统投入使用一般应先试运行至少三个月，在此过程中对出现的问题及时通过程序修改来解决。
　　3.交付和支持方面的控制
　　交付和支持方面的控制属于内部控制中的经常性控制，主要包括业务发生控制，数据输入、通讯、处理、输出、存储和检索控制。业务发生控制要对业务的合法性、合理性和完整性进行检查控制。数据输入控制要保证会计信息真实准确。数据通讯控制要保证数据通讯过程中准确、可靠、安全。数据处理控制要确保经济业务数据正确处理，防止产生错误。数据输出控制要保证输出结构及时提供给相关授权操作人员。数据存储和检索控制要确保数据及时安全存储，使用时能迅速检索到。

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