新型产琼胶酶海洋细菌的筛选和鉴定(2)
1.1 材料
1.1.1 菌株来源 大连黑石礁沿海海域自然生长的石花菜。分离培养基(2216E):蛋白胨5 g,酵母膏1 g,磷酸高铁0.01 g,琼脂20 g,陈海水1 000 mL,pH 7.2~7.8,121 ℃,20 min 灭菌后倒平板。种子培养基:琼脂1 g,其他成分同分离培养基。发酵培养基:同种子培养基。
1.1.2 主要试剂及仪器 琼脂及其他化学试剂均来自北京奥博星生物技术有限责任公司。JSM-460LV型扫描电镜(英国牛津仪器公司),722型光栅分光光度计(上海分析仪器厂)。
1.2 方法
1.2.1 产琼胶酶海洋细菌的分离 将采集的50份石花菜样品用剪刀将其剪成细小碎片,置于含有玻璃珠的海水中振荡30 min,取不同稀释梯度的菌悬液涂布在分离培养基,28 ℃培养观察。以能产生琼脂凹陷圈为标准,挑取凹陷圈较大的菌株,单菌落斜面保藏以筛选产琼胶酶性能优良菌株。
1.2.2 产琼胶酶性能优良菌株的筛选 挑取筛选菌株一环,接入装有5 mL种子培养基的大试管中, 28 ℃,150 r/min摇床培养24 h后,转接到装有30 mL/100 mL发酵培养基的三角瓶中,28 ℃,150 r/min摇床培养48 h,取培养液于8 000 r/min离心5 min后,上清液以DNS法(3, 5 - 二硝基水杨酸法)[9]测量琼胶酶活力。DNS法琼胶酶活力测定方法:取1 mL发酵上清液和1 mL磷酸缓冲液(琼脂0.2 g/L,pH 7.0)于试管内,于40 ℃温浴30 min后加入2mL DNS试剂,混合液在沸水中水浴10 min后用去离子水定容至25 mL,充分混匀后在540 nm处测量吸光度值。酶活力定义:以煮沸灭活的上清液为空白对照,以1 mL酶液1 min产1 μg还原糖定义为1个活力单位。
1.2.3 产琼胶酶海洋细菌的电镜形态观察 电子扫描电镜观察细胞形态。
1.2.4 产琼胶酶海洋细菌鉴定 菌株的形态学和生理生化特性的测定: 根据《常见细菌系统鉴定手册》所列菌种鉴定的方法进行菌种的鉴定[10]。菌株的16S rRNA基因序列测定和分析: ① 16S rRNA基因序列测定:由宝生物工程有限公司完成。②16S rRNA基因序列结果分析:将所得到的基因序列利用BLAST软件与GenBank(www.ncbi.nlm.nih.gov)数据库进行序列比对, 获取相近典型菌株的16S rRNA基因序列, 采用ClustalX和MEGA软件包进行分析, 用邻接法(Neighbor-Joining)构建系统发育树, 进行系统发育分析, 各枝上的数字是1 000次Bootstrap重抽样分析的支持百分比[11-13]。
2 结果
2.1 细菌分离结果
从50份石花菜样本中分离得到83株菌株,根据琼脂凹陷圈大小得到具有较明显分解琼脂能力的菌株30株(图1A),经卢哥氏碘液染色后产生透明圈(图1B)。
2.2 高产琼胶酶菌株的筛选
以初步分离得到的30株菌株为出发菌株,测得其48 h琼胶酶活力(表1)。其中酶活力平均值在10以上的菌株有15株,酶活力最高菌株为ZGR-26菌株,达到32.1。由于这些菌株的菌落形态较为相似,认为是同一种菌,所以选取产酶活力最高的ZGR-26菌株进行鉴定。
2.3 产琼胶酶菌株ZGR-26的形态、培养特征及理化特性
琼胶酶产生菌ZGR-26在2216E固体培养基培养48 h后观察, 菌落呈扁圆形凸起, 光滑, 比较湿润, 白色或淡黄色,透明,边缘整齐, 无可溶性色素, 周边分解琼脂产生透明凹陷。电镜观察, 细胞短杆状,(1.0~1.5) μm×(1.5~2.0) μm, 无芽孢, 革兰氏染色阴性(图2)。
ZGR-26的部分生理生化特征见表2。将该菌株与V. agarivorans进行生理生化特征鉴定比较, 结果表明菌株ZGR-26所测定的生理生化反应与V. agarivorans作为属间种的鉴别的特征基本相符(但是ZGR-26能利用蔗糖作为碳源,而V. agarivoran则不能),由此初步鉴定该菌为食琼胶弧菌。
2.4 16S rRNA基因序列分析
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