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枯草杆菌启动子43及amy的转录活性

人气指数: 发布时间:2015-04-03 10:24  来源:http://www.zgqkk.com  作者: 张婷婷
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  摘要:利用报告基因β-半乳糖苷酶,分析了枯草杆菌启动子43及amy的转录活性。结果表明,在基本培养基条件下,启动子43在对数前期开始表现转录活性,随菌量增大活性迅速提高,稳定期逐步平稳;在富营养培养基条件下,启动子43转录活性在对数前期与基本培养基条件下相似,在对数期转录活性增加速率则高于基本培养基条件下的增加速率;启动子43转录活性在E coli和B subtilis体内基本一致。启动子amy在淀粉诱导下转录活性较高,在添加葡萄糖以及无诱导条件下酶活较低。
  关键词:枯草杆菌;启动子;转录活性;基因表达
  中图分类号: Q933文献标志码: A
  文章编号:002-302(204)2-0056-02
  启动子是实现外源基因高效表达的关键,是表达载体的核心成分,启动子的转录活性分析是表达载体构建工作的重点之一。在枯草杆菌中常见启动子重叠和串连现象,例如RNA聚合酶σ43(σA)和σ37(σB)的识别区在胞嘧啶脱氨酶基因启动子43序列内重叠[2]。σ43负责营养期的基因起始转录,而σ37负责对数晚期和平台期早期的基因起始转录,因而启动子43可在多个时期起始转录,是理想的发酵工程启动子[3- 4]。本研究应用报告基因β-半乳糖苷酶基因(bgaB),分析启动子43及枯草杆菌α-淀粉酶基因启动子amy的转录活性,为进一步开发高效表达系统奠定基础。
  材料和方法
  材料
  [2]菌株B subtilis A747和E coli DH5α购自中国典型培养物保藏中心;质粒pEB-bgaB为笔者所在实验室构建,该质粒为大肠杆菌-枯草杆菌穿梭载体,携带β-半乳糖苷酶基因(bgaB)。限制性核酸内切酶、碱性磷酸酶、T4 DNA连接酶购自romage公司,Taq DNA聚合酶和LA Taq DNA聚合酶购自宝生物公司,质粒提取、DNA回收试剂盒购自杭州维特洁公司。
  2方法
  2引物设计根据NCBI数据库中B subtilis基因组上的43和amy序列设计引物,43片段扩增后保留其原有起始密码子(ATG),上下游引物分别为5′-[ZZ(Z]CCGGATCC[ZZ)]TTGTAGAGCTCAGCAT-3′(下划线为BamHⅠ酶切位点)和5′-GG[ZZ(Z]CTGCAG[ZZ)]CATGTGTACATTCCTC-3′(下划线为stⅠ酶切位点);amy片段扩增后保留了原有信号肽序列,上下游引物分别为5′-AA[ZZ(Z]GGATCC[ZZ)]GCTCATGCCGAGAATAGAC-3′(下划线为BamHⅠ酶切位点)和5′-AT[ZZ(Z]CTGCAG[ZZ)]TTCAGCACTCGCAGCCG-3′(下划线为stⅠ酶切位点)。CR扩增条件:92 ℃变性30 s,60 ℃复性30 s,72 ℃延伸30 s,循环30次。
  22[2]载体构建在载体pEB-bgaB上bgaB 5′端的BamHⅠ[2]和stⅠ酶切位点之间,分别插入经回收并酶切的CR产物43和amy,获得质粒pEB-43-bgaB和pEB-amy-bgaB;载体构建成功后,启动子片段43和amy可起始转录bgaB。载体电转入E coli DH5α后,将感受态细胞涂布在含X-gal平板,挑选8 h内出现明显蓝色菌落,提取质粒,酶切鉴定。挑取单菌落摇菌,测定整个生长时期β-半乳糖苷酶活性。
  23β-半乳糖苷酶活性测定方法和定义[5]将一定体积菌液离心收集菌体,重悬于700 μL Z-buffer(006 mol/L Na2HO4·7H2O,004 mol/L NaH2O4,00 mol/L KCl,000 mol/L MgSO4·7 H2O和005 mol/L β-巯基乙醇,pH值70),加入0 μL Triton X 00(0%)和溶菌酶0 μL[3](0 g/L),静止30 min后加入邻硝基苯-β-D-半乳吡喃糖苷(ONG)200 μL(4 g/L),混匀后置于55 ℃水浴5 min,加入[4]Na2CO3 500 μL( mol/L)终止反应,离心,取上清并测量其D420 nm。
  酶活性(U)=[SX(]D420 nm× 000D595 nm×5(min)×V[SX)](D595 nm为测前菌液吸光度;V为所用菌液的体积,mL)。
  2结果与分析
  CR扩增获得的43片段大小在250~500 bp之间,amy片段大小在500~750 bp之间(图),与预计大小相符。
  在基本培养基(胰蛋白胨%,酵母提取物05%,氯化钠%)条件下,E coli DH5α(pEB-43-bgaB)合成的β-半乳糖苷酶活性在对数前期开始表现,随着菌量增大活性迅速提高,稳定期后逐步平稳,最高可达6 650 U,稳定期后随菌群衰退酶活下降(图2)。在富营养培养基(胰蛋白胨2%,酵母提取物%,氯化钠%)条件下,E coli DH5α(pEB-43-bgaB)[CM(233]合成的 β-半乳糖苷酶活性在对数前期与基本培养基[CM)]

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