依赖解旋酶DNA等温扩增技术的研究进展
摘 要:依赖解旋酶DNA等温扩增技术(HDA)是近年来发明的一种新型的模拟动物体内DNA复制的等温扩增技术,HDA具有简便、高效、快速的优点,不需复杂的科学仪器,反应在常温下进行,适用于基层实验室,具有广阔的应用前景。
关键词:依赖解旋酶DNA等温扩增技术;DNA解旋酶;单链DNA结合蛋白
依赖解旋酶DNA等温扩增技术(HDA),是美国NEB公司在2004年发明的核酸等温扩增技术。依赖解旋酶DNA等温扩增技术是模拟动物体内DNA复制的过程,不需要在昂贵的PCR仪上进行反应,仅在恒温水浴锅上使用即可完成反应。
1 HDA 的原理
HDA的原理极其简单,首先用解旋酶解开双链DNA,然后依靠单链DNA结合蛋白(SSB)与模板单链相结合,使模板单链始终处于单链状态,同时保护它的完整性,然后模板与引物进行杂交,在DNA聚合酶的催化下进行扩增,新合成的双链DNA作为模板继续扩增。
2 HDA检测方法的建立要点
2.1 模板的选择
一般情况下,解旋酶的解旋能力决定着可扩增序列长度。HDA选用的是大肠杆菌解旋酶Ⅱ(UvrD)解旋酶,UvrD的解链速度是20bp/秒,连续性是100bp,因此进行扩增的模板长度为70~120bp。
2.2 酶的选择
目前常用的解旋酶是大肠杆菌解旋酶Ⅱ(UvrD),UvrD在核酸的核苷酸的切除修复和错配修复中起到了重要的解旋作用,UvrD是由720个氨基酸组成的,是SF1解旋酶家族一员。还有一种新发现的解旋酶—T7噬菌体基因4编码蛋白,解链速度是300bp/秒,扩增质粒DNA的长度是2.5kb,它的解链速度比UvrD更快,扩增长度更长。目前常用的SSB包括T4噬菌体基因32编码蛋白和RB49噬菌体基因32编码蛋白;常用的DNA聚合酶是Bst DNA聚合酶或者是Klenow Fragment(3′-5′exo-)聚合酶。
2.3 引物设计
引物的最适长度是25~27bp,最大不超过33bp,Tm值在60~72℃,GC含量35%~44%。
3 HDA的反应体系及操作步骤
3.1 HDA的反应体系
HDA反应体系包括混合物A和混合物B,混合物A包括引物、模板、ddH2O、缓冲液;混合物B包括SSB、UvrD、三磷酸脱氧核糖核苷、DNA聚合酶、MutL和缓冲液。
3.2 HDA的操作程序
HDA的操作程序有两种做法:两步法和一步法。两步法:混合物A放在95℃水浴加热2分钟;然后在64℃水浴中3分钟退火;加入与混合物A等体积的混合物B,置于60~65℃水浴锅中反应75~90分钟,加入终止反应液结束反应。
一步法:操作过程比两步法更简单,省去两步法中的第一步,等体积混合混合A、混合物B,放在65℃的水浴锅中进行扩增。
期刊库(http://www.zgqkk.com),是一个专门从事期刊推广、投稿辅导的网站。
本站提供如何投稿辅导,寻求投稿辅导合作,快速投稿辅导,投稿辅导格式指导等解决方案:省级投稿辅导/国家级投稿辅导/核心期刊投稿辅导//职称投稿辅导。
【免责声明】本文仅代表作者本人观点,与投稿辅导_期刊发表_中国期刊库专业期刊网站无关。投稿辅导_期刊发表_中国期刊库专业期刊网站站对文中陈述、观点判断保持中立,不对所包含内容的准确性、可靠性或完整性提供任何明示或暗示的保证。请读者仅作参考,并请自行承担全部责任。
投稿辅导服务咨询与期刊合作加盟
陆老师联系QQ: 913775405(普刊)
蒋老师联系QQ: 867306987(核心)
刘老师联系QQ: 271374912(核心)
联系电话:18015016272
17327192284
投稿辅导投稿邮箱:zgqkk365@126.com
期刊推荐
- 《课程教育研究》 旬刊 国家级
- 《网络空间安全》(信息安全与技术)月刊 国
- 《价值工程》旬刊 国家级 科技统计源期刊
- 《高教论坛》 月刊 省级
- 《法制与社会》旬刊 省级
- 《中国教育学刊》月刊 14版北大核心
- 《语文建设》 旬刊 14版北大核心
- 《中国绿色画报》 月刊 国家级
- 《社科纵横》季刊 社科类优秀期刊
- 《求索》月刊 14版北大核心期刊
- 《财会月刊》旬刊 14版北大核心
- 《艺术品鉴》 月刊 省级
- 《中华建设》月刊 国家级 建设类优秀期刊
- 《教学与管理》旬刊 北大核心
- 《当代经济》 旬刊 省级
- 《新课程研究》旬刊 省级 教育类优秀学术期
- 《文教资料》 旬刊 省级
- 《学术界》 月刊 双核心
- 《吉林教育》旬刊 省级 教育类学术期刊
- 《中国农业资源与区划》 月刊 14版北大核心
- 《继续教育研究》月刊 北大核心期刊
- 《财经界(学术版)》半月刊 国家级
- 《电影评介》半月刊 14版北大核心
- 《公路交通科技》 月刊 北大核心
- 《新闻传播》月刊 省级 新闻类优秀期刊